Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6685D3YYP3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6685D3YYP3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms