Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms