Protein–RNA interactions for Protein: D3YX43

Vsig10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10D3YX43 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig10D3YX43 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig10D3YX43 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms