Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Gm17333C6EQI3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gm17333C6EQI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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