Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms