Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms