Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms