Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU022751B1B0V2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms