Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2012B1B0R1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms