Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms