Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf25B1AWN9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms