Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plcb2A3KGF7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms