Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Atp8b5A3FIN4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Atp8b5A3FIN4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Atp8b5A3FIN4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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