Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdccag3A2AIW0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdccag3A2AIW0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms