Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms