Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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