Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PRRT1Q99946 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.7 ms