Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP53Q70EK8 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP53Q70EK8 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP53Q70EK8 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
USP53Q70EK8 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USP53Q70EK8 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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USP53Q70EK8 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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USP53Q70EK8 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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USP53Q70EK8 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP53Q70EK8 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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USP53Q70EK8 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP53Q70EK8 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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USP53Q70EK8 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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USP53Q70EK8 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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USP53Q70EK8 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP53Q70EK8 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP53Q70EK8 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP53Q70EK8 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP53Q70EK8 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP53Q70EK8 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP53Q70EK8 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP53Q70EK8 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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