Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-3.65□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
UBR3Q6ZT12 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
UBR3Q6ZT12 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
UBR3Q6ZT12 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
UBR3Q6ZT12 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms