Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRNQ16849 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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PTPRNQ16849 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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PTPRNQ16849 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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PTPRNQ16849 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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PTPRNQ16849 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRNQ16849 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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PTPRNQ16849 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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PTPRNQ16849 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTPRNQ16849 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRNQ16849 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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PTPRNQ16849 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRNQ16849 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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PTPRNQ16849 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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PTPRNQ16849 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRNQ16849 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRNQ16849 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRNQ16849 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRNQ16849 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRNQ16849 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRNQ16849 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRNQ16849 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRNQ16849 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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