Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ME3Q16798 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ME3Q16798 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ME3Q16798 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ME3Q16798 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ME3Q16798 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ME3Q16798 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ME3Q16798 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ME3Q16798 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ME3Q16798 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ME3Q16798 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ME3Q16798 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ME3Q16798 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ME3Q16798 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ME3Q16798 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ME3Q16798 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ME3Q16798 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ME3Q16798 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ME3Q16798 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ME3Q16798 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ME3Q16798 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ME3Q16798 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ME3Q16798 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ME3Q16798 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ME3Q16798 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ME3Q16798 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ME3Q16798 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ME3Q16798 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ME3Q16798 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ME3Q16798 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ME3Q16798 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ME3Q16798 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ME3Q16798 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ME3Q16798 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ME3Q16798 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ME3Q16798 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ME3Q16798 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ME3Q16798 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ME3Q16798 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ME3Q16798 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ME3Q16798 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ME3Q16798 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
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ME3Q16798 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ME3Q16798 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ME3Q16798 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ME3Q16798 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ME3Q16798 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ME3Q16798 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ME3Q16798 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ME3Q16798 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ME3Q16798 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ME3Q16798 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ME3Q16798 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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ME3Q16798 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ME3Q16798 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ME3Q16798 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ME3Q16798 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ME3Q16798 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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ME3Q16798 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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ME3Q16798 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ME3Q16798 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ME3Q16798 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ME3Q16798 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ME3Q16798 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ME3Q16798 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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ME3Q16798 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ME3Q16798 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ME3Q16798 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ME3Q16798 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ME3Q16798 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ME3Q16798 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ME3Q16798 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ME3Q16798 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ME3Q16798 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ME3Q16798 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ME3Q16798 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ME3Q16798 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ME3Q16798 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ME3Q16798 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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