Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
E2F4Q16254 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
E2F4Q16254 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
E2F4Q16254 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC1□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
E2F4Q16254 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms