Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK4Q16099 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK4Q16099 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIK4Q16099 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIK4Q16099 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.5 ms