Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMAD1Q15797 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAD1Q15797 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAD1Q15797 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.1 ms