Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TAF1CQ15572 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TAF1CQ15572 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TAF1CQ15572 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TAF1CQ15572 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TAF1CQ15572 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TAF1CQ15572 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TAF1CQ15572 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TAF1CQ15572 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1CQ15572 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1CQ15572 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TAF1CQ15572 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TAF1CQ15572 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1CQ15572 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1CQ15572 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1CQ15572 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms