Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIV2LQ15477 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKIV2LQ15477 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKIV2LQ15477 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKIV2LQ15477 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
SKIV2LQ15477 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKIV2LQ15477 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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