Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIXQ14938 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NFIXQ14938 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NFIXQ14938 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIXQ14938 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.5 ms