Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD4Q14839 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD4Q14839 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms