Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD9Q14511 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NEDD9Q14511 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NEDD9Q14511 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms