Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBE4AQ14139 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBE4AQ14139 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
UBE4AQ14139 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
UBE4AQ14139 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
UBE4AQ14139 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
UBE4AQ14139 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
UBE4AQ14139 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
UBE4AQ14139 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
UBE4AQ14139 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
UBE4AQ14139 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
UBE4AQ14139 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.4 ms