Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PDE6HQ13956 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PDE6HQ13956 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
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