Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms