Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KLF9Q13886 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
KLF9Q13886 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KLF9Q13886 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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