Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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TCIRG1Q13488 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCIRG1Q13488 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCIRG1Q13488 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCIRG1Q13488 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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TCIRG1Q13488 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCIRG1Q13488 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCIRG1Q13488 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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TCIRG1Q13488 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCIRG1Q13488 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TCIRG1Q13488 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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TCIRG1Q13488 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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TCIRG1Q13488 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCIRG1Q13488 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TCIRG1Q13488 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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TCIRG1Q13488 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
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TCIRG1Q13488 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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TCIRG1Q13488 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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TCIRG1Q13488 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCIRG1Q13488 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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