Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3FQ13275 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3FQ13275 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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SEMA3FQ13275 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SEMA3FQ13275 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SEMA3FQ13275 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SEMA3FQ13275 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SEMA3FQ13275 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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SEMA3FQ13275 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
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SEMA3FQ13275 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3FQ13275 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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