Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MKRN3Q13064 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
MKRN3Q13064 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MKRN3Q13064 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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