Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP3Q12983 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BNIP3Q12983 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BNIP3Q12983 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BNIP3Q12983 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms