Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-3.51□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CPSF1Q10570 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-3.64□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CPSF1Q10570 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
CPSF1Q10570 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
CPSF1Q10570 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
CPSF1Q10570 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CPSF1Q10570 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CPSF1Q10570 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CPSF1Q10570 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CPSF1Q10570 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CPSF1Q10570 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CPSF1Q10570 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CPSF1Q10570 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CPSF1Q10570 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CPSF1Q10570 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CPSF1Q10570 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CPSF1Q10570 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CPSF1Q10570 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
CPSF1Q10570 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-3.69□□□□□ -3
CPSF1Q10570 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CPSF1Q10570 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CPSF1Q10570 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CPSF1Q10570 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CPSF1Q10570 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CPSF1Q10570 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-3.7□□□□□ -3
CPSF1Q10570 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CPSF1Q10570 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CPSF1Q10570 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
CPSF1Q10570 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
CPSF1Q10570 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
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