Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HTATSF1O43719 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HTATSF1O43719 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HTATSF1O43719 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HTATSF1O43719 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HTATSF1O43719 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HTATSF1O43719 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HTATSF1O43719 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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