Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
APOC4-APOC2K7ER74 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.4 ms