Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SOBPA7XYQ1 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SOBPA7XYQ1 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SOBPA7XYQ1 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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