Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NIF3L1Q9GZT8 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NIF3L1Q9GZT8 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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NIF3L1Q9GZT8 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
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NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NIF3L1Q9GZT8 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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NIF3L1Q9GZT8 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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NIF3L1Q9GZT8 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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