Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VGLL1Q99990 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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VGLL1Q99990 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VGLL1Q99990 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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VGLL1Q99990 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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VGLL1Q99990 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VGLL1Q99990 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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