Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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USP43Q70EL4 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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USP43Q70EL4 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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USP43Q70EL4 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
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USP43Q70EL4 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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USP43Q70EL4 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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USP43Q70EL4 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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USP43Q70EL4 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP43Q70EL4 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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USP43Q70EL4 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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USP43Q70EL4 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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USP43Q70EL4 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
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USP43Q70EL4 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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USP43Q70EL4 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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