Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM200BQ69YZ2 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMEM200BQ69YZ2 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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