Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.73□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RTL8BQ17RB0 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.84□□□□□ -2.86
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
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