Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
IMPG1Q17R60 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IMPG1Q17R60 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IMPG1Q17R60 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IMPG1Q17R60 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IMPG1Q17R60 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IMPG1Q17R60 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IMPG1Q17R60 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
IMPG1Q17R60 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
IMPG1Q17R60 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
IMPG1Q17R60 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.4 ms