Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK5Q16478 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK5Q16478 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK5Q16478 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK5Q16478 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK5Q16478 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK5Q16478 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK5Q16478 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK5Q16478 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK5Q16478 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK5Q16478 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK5Q16478 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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