Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK4Q16099 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK4Q16099 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK4Q16099 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK4Q16099 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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