Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1EQ15878 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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